LAMMPS

LAMMPSの初期座標ファイル(dataファイル)の作成【バルク水のMD計算】

前回LAMMPSのインプットファイルを作成したので、今回は初期座標ファイル(dataファイルの作成)です。 64の水分子からなるバルク水モデルのMD計算の初期座標を作成します。 192 atoms 128 bonds 64 angles 0 dihedrals 0 impropers 2 atom types 2 bond typ…

LAMMPSのインプットファイルの構造【バルクの水のMD計算】

更新サボっていて申し訳ありませんでした。久々の更新になります。今回は前回ダウンロードしたLAMMPSを使ってバルク水の分子動力学計算を行ってみます。 これはLAMMPSのインプットファイルの構造を学ぶだけなので、インプットファイルをどうやって作成するか…

LAMMPSのインストール

今日からLAMMPSを使っていきます。 LAMMPSとはLarge-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulatorの略で分子動力学法の無償プログラムです。分子動力学法の無償プログラムは色々ありますが、LAMMPSが一番広範囲に使用できるので良く使われています…